【紹介文献】
Jpx RNA regulates CTCF anchor site selection and formation of chromosome loops
Oh et al., 2021, Cell184, 6157–6173（December 9, 2021）
【発表概要】
染色体構造は、発生、恒常性の維持、疾患の過程で動的に変化する。CCCTC結合因子（CTCF）は染色体のループを固定して3次元ゲノムを構築することが知られているが、アンカー部位がどのように選択されるかは未解明であった。
今回紹介する論文でlncRNA のJpx RNAがアンカーの選択に重要な因子であることが明らかになった。Jpx RNAを枯渇させると、CTCFが異常に結合し、大規模に染色体ループが変化し、700個以上のJpx標的遺伝子が抑制される。特に、Jpxは低親和性のCTCFモチーフをターゲットとし、競合的阻害によってCTCFタンパク質を除くことがわかった。
このことから、JpxはCTCFの放出因子として働き、アンカーサイトの利用を制御することで3次元ゲノムを形成していることがわかった。
今回のサイエンスカフェでlncRNAが染色体の構造を制御し、遺伝子の発現まで調節している一例を紹介させていただきます。
【Summary】
Chromosome structure is dynamically altered during development, homeostasis, and disease. CCCTC binding factor (CTCF) is known to anchor chromosome loops and construct three-dimensional genomes, but how the anchor sites are selected has not been elucidated.
In this paper, it was revealed that Jpx RNA of lncRNA is an important factor for anchor site selection.
Depletion of Jpx RNA causes aberrant binding of CTCF, large-scale chromosomal loop changes, and repression of more than 700 Jpx target genes.
In particular, Jpx targets low-affinity CTCF motifs and excludes CTCF proteins by competitive inhibition. This indicates that Jpx acts as a CTCF releaser and regulates the use of anchor sites to form a three-dimensional genome.
I will introduce an example of how lncRNA orderly regulates chromosome structure and gene expression.
(2022.1.13 Shonan iPark Science Cafe, 101st)
発表資料：
